1、鱼类消化道微生物与宿主互作机制研究
解析鱼类营养代谢与肠道菌群的互作机制，探索肠道菌群调控宿主免疫抗病的机理，确立肠道“有害菌”与“有益菌”的调控靶标及策略。
2、源于或靶向肠道微生物的饲用添加物开发
开展鱼类肠道土著益生菌的筛选和功能优化研究，开发靶向调控鱼类肠道有益菌和有害菌的益生元、类生元、后生元、次生元等饲用添加物。
3、水产养殖预消化饲料、功能性饲料、后消化饲料开发及数字渔仓
基于机制研究，从动物摄入、动物体和排泄三个角度，开发水产养殖3A饲料（预消化饲料、功能性饲料、后消化饲料），构建水产绿色养殖体系和数字渔仓，保障我国水产品安全。
1、 科技奖励
团队研究成果曾获第二十一届中国专利优秀奖、福建省技术发明二等奖与大北农科技成果奖一等奖。
2、 代表专利
团队获授权发明专利38项（含3项PCT授权），转让5 项，近3年内部分代表性专利如下：
1. 周志刚，杨雅麟，冉超，高辰辰，张震，解明旭，何夙旭，张进雄。一种防控水产养殖动物气单胞菌出血病的减毒活疫苗。日本专利授权号特许第6971378，授权日2021年11月4日。
2. 周志刚，霍凤敏，杨雅麟，徐俐，何夙旭，张美超，李青，余强。Chi92蛋白的新用途以及表达Chi92蛋白的菌株。日本授权专利授权号特许第6355727，授权日2018年6月22日。
3. 周志刚，赵炳超，杨雅麟，徐俐，何夙旭，张美超，冉超，于会民。一种三丁酸甘油酯的制备方法。印度授权专利号352231，授权日期2020年11月25日。
4. 周志刚，张凤丽，杨雅麟，药园园，张震，冉超，夏锐，高辰辰，杜东东，胡娟.一种构建具有降低肝脏脂肪积累且保护肠道屏障功能的基因工程菌的方法及应用. 中国发明专利 ZL 202110544436.7,授权日期2022年8月23日。
5. 周志刚，杨雅麟，胡娟，张震，药园园，冉超，杜东东，高辰辰，夏锐，张凤丽.一株水产饲用益生菌及其菌剂的制备方法，中国发明专利ZL 202110813315.8，授权日期2022年6月28日.
6. 周志刚, 杨雅麟, 高辰辰, 药园园, 夏锐, 冉超, 张震, 杜东东. 核酸酶At_NrnCM及其编码基因与应用，中国发明专利ZL 202011320304.8，授权日期2022年3月15日。
7. 周志刚，张震，解明旭，冉超，杨雅麟，高辰辰，丁倩雯，刘宏亮。一株具有降脂、抑炎、抗凋亡及抗病毒功能的水产益生菌与应用。中国发明专利授权号CN111321093 B，授权日2020年5月11日。
8. 周志刚，潘兴亮，杨雅麟，李志敏，李娟。一套高效分泌表达异源蛋白的工程菌及其应用。中国发明专利授权号CN106282079 B，授权日2019年12月31日。
9.周志刚；高辰辰；药园园；李道君；李毛毛；杨雅麟；冉超；张震；栾银银；张宇婷。一种提高草食性及杂食性水产动物健康和生长的预消化饲料。中国发明专利ZL202210552443.6，授权日2023年9月15日。
10.周志刚；高辰辰；药园园；李道君；李毛毛；杨雅麟；冉超；张震；栾银银；张宇婷。一种提高肉食性水产动物健康和生长的预消化饲料。中国发明专利ZL202210552442.1，授权日2023年9月19日。
11.周志刚；于哲；张震；药园园；杨雅麟；冉超；郝强；高辰辰。植物乳杆菌CICC6240在消减水产品体内抗生素残留中的应用。中国发明专利ZL 202211026125.2，授权日2023年9月19日。
3、 代表论文
团队累计发表SCI 论文160 余篇，近5年内部分代表性论文如下：
1. Anran Wang#, Zhen Zhang#, Qianwen Ding, Yalin Yang, Jérôme Bindelle, Chao Ran*, Zhigang Zhou*. Intestinal Cetobacterium and acetate modify glucose homeostasis via parasympathetic activation in zebrafish. Gut Microbes, 2021, 13(1): e1900996.
2. Chao Ran, Mingxu Xie*, Jie Li, Yadong Xie, Yu Li, Wei Zhou, Yalin Yang, Zhen Zhang, Rolf Erik Olsen, Zhigang Zhou*. Dietary nucleotides alleviate hepatic lipid deposition via exogenous AMP-mediated AMPK activation in zebrafish. The Journal of Nutrition, 2021, 151(10): 2986-2996.
3. Qianwen Ding, Zhen Zhang, Yu Li, Hongliang Liu, Qiang Hao, Yalin Yang, Einar Ringø, Rolf Erik Olsen, Jihong Liu Clarke, Chao Ran*, Zhigang Zhou*. Propionate induces intestinal oxidative stress via Sod2 propionylation in zebrafish. iScience, 2021, 24: 102515.
4. Juan Hu#, Yuanyuan Yao#, Yalin Yang*, Chenchen Gao, Fengli Zhang ,Rui Xia, Chao Ran , Zheng Zhang , Jihong Liu Clarke, Zhigang Zhou*. Advances of intra-species molecular typing analysis of aquatic probiotics approved by the Chinese Ministry of Agriculture. Reviews in Aquaculture, 2021, 13: 178-188.
5. Chao Ran#, Yu Li#, Xufa Ma#, Yadong Xie, Mingxu Xie, Yuting Zhang, Wei Zhou, Yalin Yang, Zhen Zhang, Li Zhou, Kaijian Wei*, Zhigang Zhou*. Interactions between commensal bacteria and viral infection: insights for viral disease control in farmed animals. Science China Life Sciences, 2021, 64(9): 1437-1448.
6. Zhen Zhang#, Chao Ran#, Qianwen Ding, Hongliang Liu, Mingxu Xie, Yalin Yang, Yadong Xie, Chenchen Gao, Hongling Zhang, Zhigang Zhou*. Ability of prebiotic polysaccharides to activate a HIF1α-antimicrobial peptide axis determines liver injury risk in zebrafish. Communications Biology, 2019, 2:274.
7. Qianwen Ding#, Zhen Zhang#, Chao Ran, Suxu He, Yalin Yang, Zhenyu Du, Jinxiong Zhang, Zhigang Zhou*. The hepatotoxicity of palmitic acid in zebrafish involves the intestinal microbiota. The Journal of Nutrition, 2018,148(8): 1217-1228.
8. Xiaoze Guo#, Chao Ran#, Zhen Zhang, Suxu He, Min Jin, Zhigang Zhou*. The growth-promoting effect of dietary nucleotides in fish is associated with an intestinal microbiota-mediated reduction in energy expenditure. The Journal of Nutrition, 2017, 147(5): 781-788.
9. Anran Wang#, Chao Ran#, Einar Ringø, Zhigang Zhou*. Progress in fish gastrointestinal microbiota research. Reviews in aquaculture, 2018, 10(3): 626-640.
10.Chao Ran#, Chubin Qin#, Mingxu Xie#, Shuning Li，Lihui Liu, Qiang Lin, Ningqiu Li, Mark Liles, Zhigang Zhou*. Aeromonas veronii and aerolysin are important for the pathogenesis of motile aeromonad septicemia in cyprinid fish. Environmental Microbiology, 2018, 20:3442-56.
11.Chao Ran#, Jun Hu#, Wenshu Liu#, Zhi Liu, Suxu He, Bui Chau Truc Dan, Nguyen Ngoc Diem, Ei Lin Ooi*, Zhigang Zhou*.Thymol and carvacrol affect hybrid tilapia through the combination of direct stimulation and an intestinal microbiota-mediated effect: insights from a germ-free zebrafish model. The Journal of Nutrition, 2016, 146:1132-40.
12.Yinyin Luan, Ming Li, Wei Zhou, Yuanyuan Yao, Yalin Yang, Zhen Zhang, Einar Ringø,Rolf Erik Olsen, Jihong Liu Clarke, Shouqi Xie, Kangsen Mai, Chao Ran, Zhigang Zhou. The fish microbiota: research progress and potential applications. Engineering.2023.
13.Zhang, Qingshuang;Yang, Hongwei;Teame, Tsegay;Ran, Chao;Yang, Yalin;Yao, Yuanyuan;Ding, Qianwen;Liu, Shubin;Li, Shengkang;Zhang, Zhen;Zhou, Zhigang. Immune disorders induced by improper use of dietary immunostimulants in aquatic animals: Research progress and prospective solutions by targeting gut microbiota. REVIEWS IN AQUACULTURE.2023: 12852.
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